Mediante a assinatura de protocolos com a FCT, foram criados, em 2019, o Consórcio das Escolas de Engenharia (CEE) e o Consórcio das Escolas de Ciências Agrárias (CECA). Em 2020, foi criado o Consórcio das Escolas de Biodiversidade e Ciências Naturais (CEBiCNa) e, em 2021, estabeleceu-se o Consórcio das Escolas de Saúde Pública (CESP) e o Consórcio de Escolas de Ciências da Vida e Biomedicina (CCVB). Finalmente, em 2022, foi criado o Consórcio das Escolas de Ciências do Mar (CEMAR). Os Consórcios de Escolas visam a dinamização do Centro Ciência LP nas suas áreas de atuação, respetivamente:
- Engenharia, tecnologia e áreas afins;
- Ciências Agrárias nas suas múltiplas vertentes, incluindo, entre outras, agricultura, florestas, produtos alimentares e produtos naturais;
- Biodiversidade e Ciências Naturais nas suas múltiplas vertentes, incluindo o estudo da ecologia, etologia e evolução, biodiversidade e serviços dos ecossistemas, biologia da conservação, genética, genómica e bioinformática, assim como as ciências fundamentais subjacentes, num contexto de alterações climáticas e de evolução social, económica e demográfica;
- Ciências da Vida nas suas múltiplas vertentes, incluindo a Saúde Pública e a Biomedicina;
- Ciências do Mar.